MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNC4

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016774	AAT	3	9	1	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016774	CATAT	2	10	75	84	40 %	40 %	0 %	20 %	374717316
3	NC_016774	GTT	2	6	89	94	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374717316
4	NC_016774	CTTCC	2	10	137	146	0 %	40 %	0 %	60 %	374717316
5	NC_016774	T	6	6	201	206	0 %	100 %	0 %	0 %	374717316
6	NC_016774	TTG	2	6	210	215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374717316
7	NC_016774	TGTA	2	8	276	283	25 %	50 %	25 %	0 %	374717316
8	NC_016774	TC	5	10	294	303	0 %	50 %	0 %	50 %	374717316
9	NC_016774	TGA	2	6	319	324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374717316
10	NC_016774	T	6	6	369	374	0 %	100 %	0 %	0 %	374717316
11	NC_016774	CCA	2	6	383	388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374717316
12	NC_016774	T	6	6	446	451	0 %	100 %	0 %	0 %	374717316
13	NC_016774	TTCG	2	8	465	472	0 %	50 %	25 %	25 %	374717316
14	NC_016774	AAT	2	6	477	482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374717316
15	NC_016774	T	6	6	528	533	0 %	100 %	0 %	0 %	374717316
16	NC_016774	T	7	7	545	551	0 %	100 %	0 %	0 %	374717316
17	NC_016774	TTGATT	2	12	568	579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374717316
18	NC_016774	CTTTTT	2	12	612	623	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374717316
19	NC_016774	TC	3	6	657	662	0 %	50 %	0 %	50 %	374717316
20	NC_016774	TCTTTT	2	12	667	678	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374717316
21	NC_016774	CATC	2	8	692	699	25 %	25 %	0 %	50 %	374717316
22	NC_016774	T	7	7	703	709	0 %	100 %	0 %	0 %	374717316
23	NC_016774	T	6	6	733	738	0 %	100 %	0 %	0 %	374717316
24	NC_016774	TG	3	6	797	802	0 %	50 %	50 %	0 %	374717316
25	NC_016774	TGG	2	6	835	840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374717316
26	NC_016774	GTT	2	6	893	898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374717316
27	NC_016774	T	6	6	897	902	0 %	100 %	0 %	0 %	374717316
28	NC_016774	ACA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374717316
29	NC_016774	GTT	2	6	946	951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374717316
30	NC_016774	T	7	7	982	988	0 %	100 %	0 %	0 %	374717316
31	NC_016774	T	6	6	1022	1027	0 %	100 %	0 %	0 %	374717316
32	NC_016774	A	6	6	1029	1034	100 %	0 %	0 %	0 %	374717316
33	NC_016774	GTT	2	6	1040	1045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374717316
34	NC_016774	GTAAC	2	10	1076	1085	40 %	20 %	20 %	20 %	374717316
35	NC_016774	TCAT	2	8	1147	1154	25 %	50 %	0 %	25 %	374717316
36	NC_016774	CTT	2	6	1172	1177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374717316
37	NC_016774	C	6	6	1318	1323	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_016774	GA	3	6	1352	1357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016774	AAT	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016774	A	7	7	1450	1456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016774	GAA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016774	CAA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016774	GAAT	2	8	1756	1763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016774	ATA	2	6	1779	1784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016774	T	6	6	1852	1857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016774	A	6	6	1875	1880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016774	TA	3	6	1893	1898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016774	ACT	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016774	ACA	2	6	1959	1964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016774	ATT	2	6	1990	1995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374717317
51	NC_016774	TAA	2	6	2000	2005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374717317
52	NC_016774	A	6	6	2087	2092	100 %	0 %	0 %	0 %	374717317
53	NC_016774	TA	3	6	2103	2108	50 %	50 %	0 %	0 %	374717317
54	NC_016774	T	6	6	2121	2126	0 %	100 %	0 %	0 %	374717317
55	NC_016774	GCTG	2	8	2158	2165	0 %	25 %	50 %	25 %	374717317
56	NC_016774	T	6	6	2367	2372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016774	A	6	6	2386	2391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016774	TAC	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016774	A	8	8	2426	2433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016774	A	6	6	2436	2441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016774	AT	3	6	2444	2449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016774	AT	3	6	2474	2479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016774	AT	3	6	2521	2526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016774	T	6	6	2557	2562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016774	T	6	6	2579	2584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016774	T	8	8	2601	2608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016774	ATA	2	6	2664	2669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016774	CAAAA	2	10	2673	2682	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016774	A	6	6	2679	2684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016774	ATA	2	6	2696	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016774	TA	3	6	2700	2705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016774	ATA	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016774	TGA	2	6	2755	2760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016774	ATAG	2	8	2825	2832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016774	TAA	2	6	2839	2844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016774	A	7	7	2843	2849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016774	CAA	2	6	2889	2894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016774	A	6	6	2928	2933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016774	AAT	2	6	2989	2994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016774	AGA	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016774	AAT	2	6	3013	3018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016774	TACT	2	8	3065	3072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.